Les enjeux liés au respect de l'environnement, au développement durable, s'imposent aux responsables logistiques magasin et nécessitent une adaptation des organisations, des procédures d'utilisation des matériels, de stockage et d'entreposage, de tri et de recyclage éventuel des déchets.
Les organisations elles-mêmes peuvent évoluer, pour optimiser l'organisation logistique (opération de groupement des livraisons sur des plateformes logistique pour réduire le trafic (transporteurs routiers), regrouper les commandes à destination des magasins du groupe, limiter les ruptures de charges).
L'informatisation de la gestion des flux et des stocks est mise en place depuis longtemps dans la plupart des magasins, mais reste inégale.
Le niveau d'automatisation est extrêmement variable selon l'organisation du magasin. Il est plus important lorsque la majorité des activités sont intégrées et que les responsables logistiques pilotent en direct les flux et les stocks. Par ailleurs, lorsqu'ils travaillent avec de nombreux fournisseurs externes et gèrent un très grand nombre de références distinctes, l'automatisation est relativement difficile.
La mise en œuvre de nouvelles technologies de traçage et de réapprovisionnement automatisés (faisant appel par exemple à la RFID) est encore rare mais pourrait se développer dans des magasins disposant d'un entrepôt important.
Pour les responsables logistiques magasin qui peuvent être amenés à travailler en direct avec une plateforme logistique (interne au groupe ou via un prestataire), cela peut nécessiter des outils de pilotage des flux et des systèmes d'information spécifiques.
Lorsque l'enseigne développe le e-commerce, le responsable logistique peut se voir confier une partie de l'organisation des flux logistiques afférents (en lien avec le responsable e-commerce) notamment pour organiser les livraisons de commandes à distance des clients depuis leur domicile. Mais un service spécifique dédié peut aussi être mis en place selon l'organisation de l'enseigne pour prendre en charge l'organisation logistique. Il en est de même par rapport à de nouveaux concepts (type drive) développés par certaines enseignes.